Les femelles donnent naissance à un seul petit et sont les seules à le porter pendant les 10-15 premiers jours. Au bout de ce laps de temps, les autres membres du groupe peuvent transporter le bébé, le rendant à la mère pour l'allaitement. Le petit, qui grandit plus vite que les autres membres de la famille des Callithricidés, est sevré vers l'âge de trois mois.
 
L'espèce est classée vulnérable sur la Liste Rouge de l'UICN à cause de sa faible densité, sa répartition inégale et la perte de son habitat. Fourrageant et se déplaçant près du sol dans des sous-bois particulièrement denses, les singes de Goeldi sont difficiles à observer. Les petites populations isolées sont les plus fragiles, c'est pourquoi l'espèce doit être protégée.